A Embraer Defesa & Segurança realiza a modernização de aeronaves, com a troca de sistemas e aviônicos existentes por versões atualizadas, sejam de aeronaves de fabricação própria ou de outras marcas, estendendo a vida útil e adequando-as às regulamentações mais recentes e às exigências das missões em mãos. Algumas das aeronaves que a Embraer já modernizou podem ser conferidas abaixo:
E-99M
Aeronaves de Alerta Aéreo Antecipado e Controle (AEW&C) fabricadas pela Embraer foram modernizadas após duas décadas de operação e mais de 30.000 horas de voo.
A-1M
Caça fabricado pelo consórcio AMX Internacional, do qual a Embraer fazia parte, incorporando novas tecnologias como HUD, HOTAS, MFD e RWR, além de novos sistemas de navegação, armamento, geração de oxigênio e contramedidas eletrônicas.
F-5M
Produzidas pela Northrop, as aeronaves F5 estão em operação pela Força Aérea Brasileira desde 1975. A aeronave recebeu novas armas e equipamentos para combate BVR (Além do Alcance Visual), além de novos softwares e outras melhorias de engenharia, trazendo uma ampla transferência de tecnologia no desenvolvimento de softwares militares com alto nível de complexidade.
A-4
A aeronave A-4 Skyhawk da Marinha brasileira, produzida pela McDonnell Douglas, foi fabricada em 1977 e recebeu novas cabines de pilotagem e foi submetida a um amplo processo de modernização de sistemas.